2001 год считается началом развития высшего фармацевтического образования в Уральском регионе, когда в соответствии с решением Министерства здравоохранения Российской Федерации №2510/6111-01-26 от 13 июня 2001 г. начался набор студентов на первый курс и организовано фармацевтическое отделение в составе лечебно-профилактического факультета, которое возглавила профессор Смоленская Ольга Георгиевна. Первый прием студентов в 2001 г. составил 56 человек.
В 2005 году решением Ученого Совета УГМА от 16.09.2005 был организован фармацевтический факультет (приказ УГМА от 3 октября 2005 №1120-р «Об организации фармацевтического факультета») и первым деканом была избрана д.м.н., проф. Смоленская Ольга Георгиевна. С 2007 по 2013 гг. фармацевтический факультет возглавлял д.фарм.н., профессор кафедры фармации Гаврилов Андрей Станиславович. С 2014 г. декан факультета – д.фарм.н., профессор Андрианова Галина Николаевна, заведующая кафедрой управления и экономики фармации.

Свое развитие факультет начал с формирования 6 кафедр: кафедра биологии, кафедра иностранных языков, кафедра общей химии, кафедра фармакологии, кафедра фармации, которую с 2003г. возглавляет д.фарм.н., профессор Петров А.Ю., курс управления и экономики фармации читался на кафедре общественного здоровья и здравоохранения. Возникла потребность в открытии новых кафедр фармацевтического профиля и в привлечении новых специалистов. Так сформировались кафедра химии фармацевтического факультета под руководством д.х.н., профессора Тхая В.Д., кафедра ботаники и фармакогнозии, возглавляемая к.б.н., доцентом Неуймин С.И. С 2009 г. и кафедра управлении и экономики фармации, зав. кафедрой д.фарм.н., профессор Андрианова Г.Н.

С 2002 года осуществляется подготовка провизоров заочной формы обучения на основе среднего профессионального фармацевтического образования, до 2012 года руководство подготовкой специалистов на заочной форме осуществлялось деканатом заочного факультета (декан — к.м.н., доцент Ивачев П.В.), с 2012 года по настоящее время — фармацевтическим факультетом.

На факультете работают высококвалифицированные специалисты: из 66 преподавателей 9 докторов наук (13,6%), 40 кандидатов наук (60,6%). Всего лиц с ученой степенью и званием – 74,2 %. На выпускающих кафедрах подготовку специалистов осуществляют 25 преподавателей, из них 6 докторов наук (24%), 12 кандидатов наук (48%), всего ППС с ученой степенью и званием 72%. На факультете работает заслуженный работник высшей школы – профессор Ларионов Л.П., основатель научной школы экспериментальной фармакологии УГМУ.

С целью обеспечения гарантий качества практической подготовки специалистов факультетом заключены договоры о совместной деятельности не только с крупными аптечными сетями Свердловской области (ГУП СО «Фармация», ЕМУП «Здоровье», ООО «Живика», «Классика», «Радуга», «Новая больница» и др.), но и научно-исследовательскими институтами (НИИ Ботанический сад УрО РАН, НИИ Органического синтеза УрО РАН), управленческими структурами (Росздравнадзор, Минздрав СО), фармацевтическими предприятиями (Уралбиофарм, Екатеринбургская фармацевтическая фабрика, Березовский фармацевтический завод), филиалом ФГУП «Микроген» — Екатеринбургским предприятием по производству бактерийных препаратов, аналитическими лабораториями (Центр Сертификации и контроля качества, Екатеринбургский клинико-диагностический центр). Кроме того, есть возможность пройти стажировку за рубежом. В 2011, 2012 и 2013 гг. по договору сотрудничества с университетом Каменского (Братислава, Словакия) группы студентов 4 курса проходили практику за рубежом, в 2014 г. – по организации фармацевтического дела в Чешской республике.

В 2015 г. состоялся 10-й выпуск провизоров. Всего факультетом подготовлено 716 выпускников-провизоров, из них ежегодно 15-20% получают диплом с отличием, 7-10% выпускников остаются в науке. На профильных кафедрах факультета, начиная с 2006 г. по 2015 г., прошли специализацию около 700 интернов, ежегодно проходят подготовку на курсах повышения квалификации более 50 практических работников.

В 2020году состоялся 15-й выпуск специалистов – провизоров. Всего фармацевтическим факультетом было подготовлено 1009 выпускников, большинство из них начинают профессиональную деятельность в аптечных организациях Свердловской области или продолжают обучение в ординатуре и аспирантуре.

В 2022 году число выпускников составило 1084 человека. Более 80% выпущенных специалистов работают по специальности. С 2022 года открыто новое направление 33.04.01 Магистратура «Промышленная фармация»

С 2023 года на факультете реализуются дополнительные образовательные профессиональные программы по направлениям: «Производство фреш-сырья из лекарственных растений», «Провизор-управленец», «Производство радиофармацевтических препаратов». По направлению «Производство фреш-сырья из лекарственных растений» обучились 17 студентов, по направлению «Провизор-управленец» — 23 студента, по направлению «Производство радиофармацевтических препаратов» — 6 студентов.