История кафедры тесно связана с развитием офтальмологии на Среднем Урале. Кафедра глазных болезней была создана для подготовки врачей-окулистов на медицинском факультете Уральского государственного университета в 1921 году и работала до 1924 года (до перевода факультета в Пермь) под руководством Г.И. Замуравкина. Преподавание глазных болезней в Свердловске возобновляется в 1935 году, когда на базе глазной лечебницы им. Миславского была создана кафедра глазных болезней Свердловского медицинского института, которую возглавил профессор Р.Х. Микаэлян. Далее кафедрой руководил доцент, кандидат медицинских наук Г.Ф. Лужинский, доцент, кандидат медицинских наук А.Н. Микаэлян.

Профессор, доктор медицинских наук Е.Г. Михеева возглавляла кафедру в 1964-1965 и 1971-1992 годах. Под ее руководством выполнено и защищено пять кандидатских диссертаций. Научными проблемами кафедры оставались глаукома и травмы органа зрения. Благодаря усилиям Е.Г. Михеевой в 1976 году были организованы два областных центра (глаукомный и офтальмотравматологический), в 1976-1977 годах внедрена микрохирургическая техника оперативных вмешательств на глазном яблоке, а в 1981 году выполнена первая в Свердловске операция имплантации искусственного хрусталика.

С 1992 года кафедрой заведует профессор С.А. Коротких. Под его руководством выполнено и защищено свыше 20 кандидатских, с 2009г. защищено 4 докторские диссертации, в трёх из которых он являлся научным консультантом, получены десятки патентов на изобретения и опубликованы сотни научных работ, издан ряд сборников научных работ (1997, 2010, 2013, 2015 гг.), издано более 20 методических рекомендаций для врачей, ведется активная лечебная, научная и методическая работа на клинических базах. За период с 1992 года организованы новые базы кафедры: Свердловский областной клинический психоневрологический госпиталь для ветеранов войн (два глазных отделения), ГКБ №23 (офтальмотравматологический центр), Научно-практический реабилитационный центр «Бонум» (Областной детский офтальмологический центр и Центр ретинопатии недоношенных), Детская многопрофильная больница №9, Медицинская клиника «Профессорская Плюс» (диагностика и амбулаторная офтальмохирургия).

В 2012 году кафедра официально переименована в кафедру офтальмологии.